חישוב מכניקת הקוונטים החישובית: 4 שלבים

2024 מְחַבֵּר: John Day | [email protected]. שונה לאחרונה: 2024-01-30 09:14

חישובים חישוביים בכימיה ובפיזיקה יכולים לחשוף מאפיינים מעניינים מאוד בכמה דגימות (במיוחד אם הם כפופים לשינוי ליעילות טובה יותר של תרכובת מקורית נתונה). בהליכים, מלבד גורמים של רגע דיפול, חוסר יציבות, מפת פוטנציאל אלקטרוסטטית, תרשים אנרגיה וחישובי תגובתיות פרוביליסטית, כאשר השימוש בחישובים קוונטיים חישוביים מקצר את זמן המעבדה, מה שהופך אותו ברור וספציפי אם הסינתזה של תרכובת אפשרית היא כדאית. אמירה כלכלית וזמנית.

אספקה

• קוונטי
• דוגמנות מולקולות.
• אורביטלים מולקולריים אורקה אבוגדרו

שלב 1: חישוב מכניקת הקוונטים החישובית - Avogadro

כצעד ראשון, הורד את Avogadro שיש לו אפשרות קלט עם תוכנת Orca

בתוכנת Avogadro מובטח לך ליצור את המולקולות שלך ולייעל אותן ב -99.9%; כדי להימנע מעימותים עם הפקודה Ctrl + Alt + o, שבתורה אינה מבטיחה דחיסה מולקולרית תקינה בעת שימוש בתוספי קלט עבור Orca.

כדי לייעל את המולקולה, ראשית צור את מולקולת העניין (ברור), ולאחר מכן לחץ על ה- E (שים לב שמתחת ל- E זה יש חץ למטה), כך שחישוב דומה יופיע בפינה השמאלית העליונה של המסך המכיל את התוכנה.

שלב 2: תוכנת אורקה

כאשר קלט זה נעשה כראוי, לחץ על הכרטיסייה הרחבות, עדיין מתייחס לתוכנת Avogadro, וחפש את האפשרות ORCA

לחץ על מתקדם, כאשר המסך ליצירת הקלט נפתח, ועל תאריך סמן את האפשרות MO והשני למטה. - להשאיר שני סימנים - כדי לקבל צפיפות אלקטרונים ואורביטלים מולקולריים מופעלים במהלך חישובים קוונטיים שאורקה תבצע - הליכי קלט בלבד;)

לאחר הליך כזה בכרטיסייה בסיסי, השלם לאחר הפקודה:! RHF SP def2-SVP

הזן את הקוד נכון / בזהירות …

! הדפסה רגילה

אחוז תפוקה

הדפס [P_Basis] 2

הדפס [P_MOs] 1

סוֹף

DETAIL, לפני ביצוע פעולה כזו הורד והתקן את Orca במחשב שלך!

לאחר ביצוע הפקודות לעיל, לחץ על צור ושמור קובץ כזה. קלט בתיקייה שבה מותקנת אורקה. (דוגמה: התקנתי את אורקה בכונן C של המחשב שלי -> שמור את הקובץ בתוך כונן C של המחשב שלך בתוך תיקיית אורקה).

שלב 3: ב- Cmd Run …

פתח cmd והקלד:

תקליטור C: / אורקה; תוכנת Orca מותקנת בכונן C של המחשב שלך … ולחץ על enter.

תקבל מסך הדומה לתמונת החלק הזה, לאחר הליך כזה, שים לב אם הפקודה מתאימה לפי הסקריפט C: / Orca> אם פקודה זו נכונה, הקלד מול סימן הפלוס (>) הפקודה:

orca.exe (שם המולקולה ששמרת בתיקיית Orca).inp> (שם המולקולה ששמרת בתיקיית Orca).

פרטים - אין קרובי משפחה בפקודה ורק השם של המולקולה שלך

לאחר מכן הקש enter והמתן … במקרה שלי פיספסתי את הפקודה מספר פעמים מכיוון שהריבוי הכרוך הוא ערך אי -זוגי וגם מספר האלקטרונים שלי הוא מוזר, אם זה קורה שנה את ערך הריבוי לשני בשלב הקודם ב- Basic (ב- תוכנת Avogadro).

שלב רביעי: המתן דקה…

לאחר מתן הפקודה, חפש קו תחתון בשורת הפקודה הבאה של cmd

אם יש, WONDER, ממשיך … המתן זמן עד שמופיע התסריט יופיע:

תקליטור: / אורקה_

כדי לוודא שקובץ ה- out שלך נוצר בתוך תיקיית ההתקנה של Orca, זה שבו נשמר קובץ הקלט שנוצר ב- Avogadro.

לאחר שהחישוב נעשה באמצעות cmd באורקה, חפש את קובץ ה- out בתיקיית Orca. ברגע זה תוכל לסגור את המולקולה שלך (Avogadro) ו- cmd, בסופו של דבר החישוב הקוונטי כבר נעשה …

בשלב הבא, פתח שוב את Avogadro ובכרטיסייה הפתוחה, חפש את קובץ ה-.out שנוצר ופתח אותו; תראה שתהיה המולקולה שלך ליד ערכי HOMO ו- LUMO Orbital, גרור מעט את הכרטיסייה למטה ותראה שיש חישובים לאורביטלים שיעניקו בערך 100% אופטימיזציה, כפי שהתמונה חושפת.

…ותהנה…